基因组学研究室重点研究薯类作物基因组组成、进化、结构以及结构与功能的关系，为其生物学特性的遗传解析提供基础理论支撑。主要依托单位为农业基因组所，团队组成包括黄三文研究员、李广存研究员、曹清河研究员等。

一、科研项目

基因组学研究室主持科研项目8项，其中主持国家自然科学基金3项、科技部国际科技合作重大项目1项、农业部其它财政专项2项、地方财政项目2项。目前，已构建了马铃薯全基因组序列图谱，提示了几种遗传多样性及其驯化的基因组学基础，解析了多个产量和品质性状的遗传基础和分子机制，在Nature、Science、Nature Genetics、Nature Plants、PNAS和Plant Cell等期刊发表了百余往篇SCI论文。

    二、研究进展

     基因组学研究室在马铃薯基因组学、重要农艺性状基因克隆、二倍体马铃薯分子育种等方面均取得较大进展：

（1）完成了首个马铃薯参考基因组的测序，加速了马铃薯生物学研究和分子育种工作，研究成果以封面文章的形式发表在《Nature》杂志，入选2011年“世界十大科学进展新闻”。

（2）通过基因组编辑技术克服了马铃薯自交不亲和的难题，获得了自交亲和的二倍体马铃薯，为创制自交亲和的二倍体马铃薯提供了新路径，研究成果发表在《Nature Plants》杂志。

（3）解析了马铃薯自交衰退的遗传基础，提出了克服自交衰退的方法，为二倍体马铃薯育种奠定了理论基础，研究成果发表在《Nature Genetics》杂志

（4）培育了第一代二倍体马铃薯自交系和杂交种，证明了二倍体马铃薯育种的可行性，为下一步培育商业化二倍体马铃薯杂交种奠定了良好的基础。

图1 利用基因组编辑技术创制自交亲和的二倍体马铃薯	图2 三个自交群体全基因组范围内的偏分离及自交衰退相关表型

    三、人才培养与团队建设

研究室共有博士后5名，博士生6人，硕士生10人。2019年经济作物全基因组设计育种团队获得中国农业科学院优秀创新团队。